Atelier Shallie: Alchemists of the Dusk Sea

Oyunun hikayesi, Atelier Ayesha: The Alchemist of Dusk'ın başlangıcından yaklaşık 10 yıl ve Atelier Escha & Logy: Alchemists of the Dusk Sky'ın başlangıcından 6 yıl sonra geçmektedir. Bir vaha kasabasındaki su kaynakları kurudukça bitkiler solmakta ve hayvanlar aç kalmaktadır. İşte tam bu noktada, hayatlarını kazanmak için farklı yöntemler kullanan iki simyacı karşılaşır. Shallistera köyünü yok olmaktan kurtarmanın bir yolunu bulmayı hedeflerken, Shallotte Elminus ise iyi bir simyacı olma çabasıyla günlük yaşamına devam etmektedir.[13][23][24] Shallistera'nın hikayesi, Dusk serisi boyunca işlenen gerçekleri ve gizemleri gün yüzüne çıkarırken, Shallotte'nin hikayesi dünyadaki günlük yaşam etrafında şekillenecektir. Birbirleriyle tanıştıktan sonra Shallistera ve Shallotte, birlikte çalışarak hedeflerini gerçekleştirdikçe gelişecekler ve ikilinin dostluğu, hikayenin odaklanacağı unsurlardan biri olacaktır.